Phylogenetic characterization and determination of antibiotic susceptibility of avian pathogenic Escherichia coli strains isolated from broiler visceral organs
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Date
2023Palabras Clave
Pollos de engorde, Biología molecular, Escherichia coli, Genética, MicrobiologíaBroilers, Molecular biology, Escherichia coli, Phylogenetic, Susceptibility
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Abstract
The study aims to identify phylogenetic groups and antibiotic
susceptibility of poultry Escherichia coli (APEC) isolates. E. coli was
phenotypically and biochemically characterized. Isolates from 8/30
(26.66%) liver, 7/30 (23.33%) heart, and 4/30 (13.33%) spleen of 37-42
days old vaccinated broiler chickens were assessed. Then the E. coli
isolates (19/90; 21.11%) were phylogrouped by quadruplex genotyping
based on the presence or absence of arpA, chuA, yjaA genes, and
TspE4.C2 DNA fragment.The majority of APEC strains belonged to
phylogenetic group C, followed by groups A, E, and F. Phylogroup C
was observed in the liver, phylogroup A in both liver and heart samples,
phylogroup E in the heart and spleen, and phylogroup F in the liver. The
highest antibiotic resistance was observed in Amoxicillin-Clavulanic
acid and Ampicillin (100%) predominantly in groups A and E according
to antibacterial susceptibility tests. Multiple antibiotic resistance
(MDR) for APEC strains was also found at 68.42% (13/19). Of the 19
isolates tested, only 13 (68%) were susceptible to high levels of
gentamicin. APEC strains belonging to phylogroups C, A, and E are
of epidemiological importance for broilers. It would be beneficial to
investigate new phylogroups by performing more detailed genotypic
analyzes in APEC strains.
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Información Adicional
| Otros Títulos | Caracterización filogenética y determinación de la susceptibilidad a los antibióticos de cepas patógenas de Escherichia coli aviar aisladas de órganos viscerales de pollos de engorde |
| Correo Electrónico | volkan.ozavci@deu.edu.tr |
| Editor | SaberULA |
| ISSN | 0798-2259 |
| ISSN Electrónico | 2477-944X |
| Resumen en otro Idioma | El estudio tuvo como objetivo identificar los grupos filogenéticos y la susceptibilidad a los antibióticos de los aislados de Escherichia coli de aves de corral (APEC). E. coli se caracterizó fenotípica y bioquímicamente a partir de hígado, 8/30 (26,66 %); corazón, 7/30 (23,33 %) y bazo, 4/30 (13,33 %) de pollos de engorde de 37-42 días de edad vacunados. Luego, los aislados de E. coli (19/90; 21,11 %) se filoagruparon mediante genotipado cuádruple en función de la presencia o ausencia de los genes arpA, chuA, yjaA y el fragmento de ADN TspE4.C2. La mayoría de las cepas APEC pertenecían al grupo filogenético C, seguido de los grupos A, E y F. El filogrupo C se observó en el hígado, el filogrupo A en las muestras de hígado y corazón, el filogrupo E en el corazón y el bazo y el filogrupo F en el hígado. La mayor resistencia antibiótica se observó en amoxicilina-ácido clavulánico y ampicilina (100 %) predominantemente en los grupos A y E según pruebas de susceptibilidad antibacteriana. También se encontró resistencia múltiple a antibióticos (MDR) para las cepas APEC en 68,42 % (13/19). De los 19 aislamientos probados, solo 13 (68 %) fueron susceptibles a niveles altos de gentamicina. Las cepas APEC pertenecientes a los filogrupos C, A y E son de importancia epidemiológica para los pollos de engorde. Sería beneficioso investigar nuevos filogrupos realizando análisis genotípicos más detallados en las cepas APEC. |
| País | Venezuela |
| Institución | Universidad del Zulia (LUZ) Universidad de Los Andes (ULA) |
| Publicación Electrónica | Revista Científica |
| Sección | Revista Científica: Artículos |